在黄昏雪中的某个教会，伊达京介被不知被什么人袭击即将断气的母亲亲手刺中心脏——这就是一切的开端。被误认为死去而被埋葬的京介，被美少女岬真夜从墓中掘出，而真夜却又被拥有世界级科技水平的大型跨国企业桐原集团绑架，京介自己也被神秘的变异人组织Hospital的刺客袭击。在陷入窘境的京介面前又出现了神秘男子壬生士郎，他告诉了京介出生后就被分开的双胞胎妹妹，以及她的分身Flicker的存在，而真夜即是Flicker中的一个。母亲的死和妹妹的谜团萦绕在京介脑中不知其解。为了救出真夜，京介与士郎一同闯进了桐原集团的海上设施……
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